L’Institut d’Etudes Latino-Américaines fait partie de l’École Nationale d’Études Politiques et Administratives (SNSPA) et a une double subordination : subordination au Sénat de l’École Nationale d’Études Politiques et Administratives et subordination au Conseil du Département des Relations Internationales et d’Intégration Européenne.
ISLA a la capacité d’autofinancer ses activités par des mécanismes tels que : des fonds provenus des projets auxquels l’institut participe en tant que coordonnateur ou participante, des fonds accordés par les organismes de parrainage, des donations, des ressources mises à sa disposition par des partenaires.
L’Institut sera dirigé par un Conseil directeur, qui sera présidé par le directeur de l’ISLA. Les détails supplémentaires sur l’organisation, la coordination et la conduite de l’Institut sont disponibles dans le Règlement d’organisation et fonctionnement de celui-ci.